Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms