Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms