Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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TchpQ3TVW5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TchpQ3TVW5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TchpQ3TVW5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TchpQ3TVW5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TchpQ3TVW5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms