Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TQQ9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms