Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms