Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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