Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl9Q32KG4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl9Q32KG4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms