Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom4Q1W617 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom4Q1W617 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom4Q1W617 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom4Q1W617 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom4Q1W617 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom4Q1W617 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom4Q1W617 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom4Q1W617 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom4Q1W617 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom4Q1W617 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom4Q1W617 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom4Q1W617 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shroom4Q1W617 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Shroom4Q1W617 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shroom4Q1W617 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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