Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
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ptchd1Q14B62 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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ptchd1Q14B62 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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ptchd1Q14B62 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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ptchd1Q14B62 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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ptchd1Q14B62 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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ptchd1Q14B62 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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ptchd1Q14B62 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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ptchd1Q14B62 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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ptchd1Q14B62 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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ptchd1Q14B62 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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ptchd1Q14B62 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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