Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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