Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli2Q0VGT2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli2Q0VGT2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms