Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms