Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms