Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms