Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntnap5bQ0V8T8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntnap5bQ0V8T8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms