Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms