Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms