Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms