Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col17a1Q07563 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms