Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms