Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sox9Q04887 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sox9Q04887 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sox9Q04887 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sox9Q04887 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sox9Q04887 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sox9Q04887 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sox9Q04887 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sox9Q04887 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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