Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RelaQ04207 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RelaQ04207 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RelaQ04207 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RelaQ04207 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RelaQ04207 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RelaQ04207 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RelaQ04207 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RelaQ04207 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RelaQ04207 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RelaQ04207 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RelaQ04207 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RelaQ04207 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms