Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pfdn6Q03958 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pfdn6Q03958 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pfdn6Q03958 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pfdn6Q03958 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pfdn6Q03958 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pfdn6Q03958 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pfdn6Q03958 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pfdn6Q03958 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pfdn6Q03958 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pfdn6Q03958 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pfdn6Q03958 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pfdn6Q03958 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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