Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms