Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms