Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnb1Q02248 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms