Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms