Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mc1rQ01727 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms