Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms