Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms