Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms