Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabpaQ00422 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms