Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gabpb1Q00420 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gabpb1Q00420 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gabpb1Q00420 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gabpb1Q00420 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gabpb1Q00420 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gabpb1Q00420 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gabpb1Q00420 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gabpb1Q00420 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gabpb1Q00420 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gabpb1Q00420 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gabpb1Q00420 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gabpb1Q00420 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gabpb1Q00420 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gabpb1Q00420 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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