Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms