Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarcc1P97496 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms