Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cmklr1P97468 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cmklr1P97468 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cmklr1P97468 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cmklr1P97468 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cmklr1P97468 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cmklr1P97468 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cmklr1P97468 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cmklr1P97468 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cmklr1P97468 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cmklr1P97468 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cmklr1P97468 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cmklr1P97468 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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