Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig3P97386 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig3P97386 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig3P97386 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms