Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme1P97371 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psme1P97371 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms