Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms