Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tubg1P83887 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tubg1P83887 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms