Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1146.9 ms