Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ptprn2P80560 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ptprn2P80560 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ptprn2P80560 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ptprn2P80560 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ptprn2P80560 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ptprn2P80560 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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