Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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