Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc8a1P70414 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8a1P70414 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms