Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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SeboxP70368 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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SeboxP70368 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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SeboxP70368 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms