Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms