Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps4xP62702 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms