Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Lmo4P61969 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lmo4P61969 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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