Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga11P61622 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga11P61622 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms