Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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